Tartalomra ugrás
CF

compsort for Mac

Kiadó: Paul A. Wilson
Mac Free
Letöltés v1.01 29 letöltések
Változat1.01
Kiadó Paul A. Wilson
Kiadási dátum2008. aug. 25.
Dátum hozzáadva2004. aug. 11.
Os követelményekMacintosh, Mac OS X 10.3
KövetelményekMac OS X 10.3
Összes letöltés29
ÁrFree

Leírás

Parancssori eszköz a vesszővel tagolt adatfájlok összehasonlításához relatív különbségek segítségével, hogy meghatározza a leginkább hasonló konformációkat. A Compsort összehasonlítja az adatfájlokat relatív különbség segítségével, hasonlósági pontszámot számol, a pontszámokat növekvő sorrendbe rendezi (az alacsonyabb értékek nagyobb hasonlóságot jelentenek), X számú alacsony pontszámot ment el.

A felhasználó által előállított adatfájloknak vesszővel tagolt szövegfájloknak kell lenniük. Minden fájl egy egyedi molekulát képvisel. A fájl minden sora a molekula egyedi konformációját jelenti. Az adatfájl első oszlopának a sor által képviselt konformációra egyedi címkének kell lennie. A többi oszlop numerikus leíró, például távolságmérés.

A sorokat kombinatorikusan hasonlítjuk össze a fájlok között. Az összehasonlított címkéket a rendszer összefűzi és elmenti a sorok pontszámaival. Ez lehetőséget ad azoknak a konformációknak az azonosítására, amelyek adott hasonlósági pontszámot eredményeztek.

A jövőbeni munkák a következőket tartalmazzák:

GUI interfész hozzáadása

cikk közzététele a 3D farmakofor modellező algoritmusomról

Párhuzamos verzió MPI-t használva

Hasonló programok

Alternatívák

Több ettől a kiadótól