Toxtree

Leírás

A Toxtree egy teljes értékű és rugalmas, felhasználóbarát nyílt forráskódú alkalmazás, amely döntési fa megközelítés alkalmazásával képes megbecsülni a toxikus veszélyt. A Toxtree különféle kompatibilis fájltípusokból származó adatkészletekre alkalmazható. A felhasználó által definiált molekuláris struktúrák is támogatottak, és bevihetők a SMILES segítségével vagy a beépített 2D szerkezeti diagram szerkesztő használatával. Tartalmaz néhány toxicitás-előrejelző modult: Toxicitási mód a Verhaar-sémán keresztül, a bőrirritáció előrejelzése, a szemirritáció előrejelzése, a START biológiai lebomlás és a perzisztencia előrejelzése, a szerkezeti figyelmeztetések a Michael-akceptorok azonosítására, a szerkezeti figyelmeztetések a bőrszenzibilizációhoz, a Kroes TTC döntési fa, Szerkezeti riasztások rágcsálókon végzett in vivo mikronukleusz-vizsgálathoz (ISSMIC) és Strukturális riasztások funkcionális csoportok azonosításához (ISSFUNC). A Toxtree egy plug-in keretrendszert biztosít a becslés különböző megközelítéseinek beépítéséhez.